Serial opowiada o nietypowej parze agentów FBI. Fox Mulder (David Duchovny) i Dana Scully (Gillian Anderson) prowadzą tytułowe Archiwum X, komórkę Federalnego Biura Śledczego, do której trafiają wszystkie sprawy nie dające się wyjaśnić na drodze konwencjonalnego rozumowania. Mulder głęboko wierzy w istnienie istot pozaziemskich i innych niewytłumaczalnych zjawisk, będących przedmiotami ich śledztw. Praca w Archiwum X jest dla niego próbą wyjaśnienia zagadki zaginięcia swojej siostry, która – jak twierdzi Mulder – została porwana przez obcych. Scully natomiast, jako naukowiec, jest bardzo sceptycznie nastawiona do wszelkich badanych przez nich spraw, choć w toku wydarzeń sama także zaczyna wierzyć w paranormalne zjawiska. Z czasem do Muldera i Scully dołączają agenci John Doggett (Robert Patrick) i Monica Reyes (Annabeth Gish), tworząc drugi duet pracowników Archiwum X.

Po 10 latach, pisarz Nick Garrett (Bryan Greenberg) wraca w rodzinne strony, aby wygłosić wykład na tamtejszej uczelni. Spotkanie z rodziną, przyjaciółmi i dawną miłością skłania go do pozostania w Knights Ridge na dłużej.. Czy uda mu się odzyskać przyjaciół.. i Hannah (Laura Prepon)?

Serial opowiada o perypetiach Gary’ego Hobsona (Kyle Chandler), który co ranek otrzymuje gazetę z wydarzeniami z następnego dnia. Znając wydarzenia z przyszłości, stara się zapobiec niektórym z nich, ma jednak na to zaledwie 24 godziny.

Były agent FBI, Frank Black, ma zostać konsultantem tajemniczej organizacji Millennium. Zajmuje się głównie przestępstwami o naturze religijnej. Nie wie jednak, że Millennium to tajna, ponadtysiącletnia organizacja, która wykorzystuje go, by osiągnąć swoje własne cele. Chris Carter stworzył bardzo mroczny obraz, nie tylko dla tego, że większość scen odbywa się w nocy lub ciemnej scenerii, ale także dlatego, że postawił na apokaliptyczno-apokryficzny charakter serialu.

Serial opowiada o trzech najlepszych ratownikach medycznych w Chicago, których czasami głupawe, przekonane o swojej nieomylności i nawet autodestruktywne charaktery sprawiają, że nie nadają się do utrzymywania związków, przyjaźni i większości zajęć zawodowych. Są oni jednak niezwykle wykwalifikowani do ratowania każdego, kto wyląduje w ich karetce.