Gwiezdne wrota: Atlantyda (Stargate Atlantis) to spin-off popularnego serialu Gwiezdne wrota SG-1. Jego fabuła rozgrywa się wokół wielonarodowej wyprawy naukowo - wojskowej, której przewodniczy dr Elizabeth Weir. Ta wyprawa to podróż w jedną stronę w kierunku Atlantydy. Ich misją jest odnalezienie tajemnic Atlantydy, miasta zbudowanego przez Starożytnych i sprowadzenie na Ziemię wszystkiego, co tylko uda się im stamtąd wywieźć. Naukowcy będą zdani tylko na siebie, bez żadnej pomocy i środków na powrót. Wrócą, jeśli sami odnajdą na Atlantydzie technologię, która im w tym pomoże. Na miejscu naukowcy znajdują opuszczone miasto, pozostawione w wiecznym śnie na kilka tysięcy lat. Nie mogą liczyć na szybki powrót do domu. Muszą odnaleźć tam źródło energii, gdzieś na galaktyce Pegaza, korzystając z tego samego systemu Gwiezdnych wrót, przy pomocy którego tam dotarli. Jeśli im się nie powiedzie, ugrzęzną tam na wielki. Na pierwszej planecie, na której lądują, przypadkiem pobudzają do życia najgorszego wroga, z jakim przyszło im walczyć – Widma.

Sam Winchester dorastał polując na takie właśnie, przerażające rzeczy. Jednak to już przeszłość. Teraz chce studiować prawo, żyć spokojnie i normalnie. I tak jest do chwili, kiedy jego starszy brat Dean zjawia się z niepokojącymi wiadomościami: ich ojciec, człowiek, który od 22 lat polował na zło, zniknął. Teraz, aby go odszukać, bracia muszą zapolować na to, na co on polował... a Sam będzie zmuszony powrócić do życia, które miał nadzieję, na zawsze zostawił za sobą.