Po powrocie pułkownika O’Neilla z misji na Abydos, Gwiezdne wrota zostały wyłączone i przechowywane były w bazie Cheyenne. Rok później Wrota aktywowały się i wyszła z nich grupa obcych zwanych Goa’uldami, która napadła na bazę. Jej dowódca, gen. Hammond poprosił pułkownika O’Neilla o powrót do służby i pomoc w poprowadzeniu kolejnej misji na Abydos. Na miejscu ekipa z Ziemi spotkała doktora Jacksona, który został na planecie po pierwszej wyprawie. Odkrył on, że w galaktyce istnieje cała sieć Gwiezdnych wrót. Oznaczało to, że skoro obcy nie przyszli z Abydos mogli wrócić na którykolwiek z tysięcy adresów. Kolejny atak obcych, tym razem na mieszkańców Abydos umożliwił Ziemianom odnalezienie i uratowanie porwanych.

Serial ten to prowokująca telewizyjna antologia, wielokrotnie uhonorowana nagrodami Emmy. Podobnie jak w przypadku klasycznego już serialu z lat. 60.tych, pod tym samym tytułem, każdy odcinek jest celebracją ludzkiej wyobraźni, badań nad przekraczaniem nowych granic z zakresu technologii, kosmosu i ludzkich doświadczeń, które ujawniają nasze największe nadzieje i największe obawy. Historie, podejmowane w serialu rozwijają konsekwencje kontrowersyjnych i prowokujących tematów takich jak manipulacja genetyczna, wizyty Obcych na Ziemi, oraz kwestię życia po śmierci.

Akcja rozgrywa się w małym miasteczku Cicely na Alasce, zamieszkałym przez 839 mieszkańców. Przybywa tam ze swoim bagażem doświadczeń młody lekarz dr Joel Fleischman aby odpracować studia medyczne. Niestety jest on z tego faktu bardzo niezadowolony (zostawił w swym rodzinnym mieście narzeczoną, a poza tym nie znosi takich 'dziur'). W Cicely poznaje Maggie O Connell, pilota samolotu, która wynajmuje mu domek. Wkrótce poznaje też Chrisa 'O poranku' - dj-a lokalnej stacji radiowej, Mauricea - byłego członka NASA, Hollinga i Shelly - właścicieli jedynej knajpy, Eda Chigliaka - miłośnika filmów i przyszłego szamana, Ruth - właścicielkę sklepu, Walta - trapera, czy w końcu swą 'małomówną' sekretarkę Marilyn. Serial zyskał sobie wielką popularność w większości krajów w jakich był pokazywany.

Były agent FBI, Frank Black, ma zostać konsultantem tajemniczej organizacji Millennium. Zajmuje się głównie przestępstwami o naturze religijnej. Nie wie jednak, że Millennium to tajna, ponadtysiącletnia organizacja, która wykorzystuje go, by osiągnąć swoje własne cele. Chris Carter stworzył bardzo mroczny obraz, nie tylko dla tego, że większość scen odbywa się w nocy lub ciemnej scenerii, ale także dlatego, że postawił na apokaliptyczno-apokryficzny charakter serialu.