W 2008 roku, licealistka Sakura Minamoto zginęła potrącona przez ciężarówkę. Dziesięć lat później, Sakura wraz z sześcioma "legendarnymi" dziewczynami z różnych epok historii Japonii, zostają sprowadzone do życia jako zombie przez mężczyznę o imieniu Kotaro Tatsumi, który stara się ocalić prefekturę Saga, tworząc grupę idolek z zombie.

Podobnie jak w japońskiej trupie teatralnej Takarazuka Revue, tak w Kouka Kageki Musical Drama Academy wszystkie role teatralne, zarówno męskie, jak i żeńskie, grane są przez kobiety. Narada Ai to zobojętniała była idolka, która zostaje aktorką musume-yaku (gra role kobiece). Sarasa Watanabe to jasnooka dziewczyna pochodząca ze wsi, która jest aktorką otoko-yaku (gra role męskie). Przygoda w muzycznej akademii pełnej chaosu, intryg i oczekiwań rozpoczyna się już teraz!

W 2024 roku ruiny Japonii zamieszkują surrealistyczne potwory, a ocalali ludzie walczą o przetrwanie. Kiruko postanawia spełnić ostatnie życzenie tajemniczej umierającej kobiety, by zabrać jej syna Maru do miejsca zwanego Niebem.