Fabuła „Ghost” składa się z trzech, powiązanych ze sobą historią, opowieści. Pierwsza z nich, „Hands that Call” opowiada o przypadkowej śmierci jednej z uczennic. Pragnąć dosięgnąć małego kotka dziewczyna spada do piwnicy starej, opuszczonej szkoły. Choć wysokość nie jest duża, uczennica łamie kark i umiera. Drugi epizod, „Stay By Me” opowiada historię przyjaźni (miłości?) miedzy dwiema uczennicami, So-yeong i Nam-heui. Nam-heui była związana z klasowym prymusem, lecz gdy chłopka dowiedział się o ciąży, zerwał z dziewczyną. Zrozpaczona, osamotnia wsparcie znalazła w So-yeong, która staje się największą przyjaciółką Nam-heui. „Ghost Boy”, Cheol-min jest uczniem, który skrywa mroczny sekret. Widzi duchy zmarłych. Dar szybko okazuje się przekleństwem. Okazuje się także, że dziewczyna jest ofiarą seryjnego mordercy, który nawet po śmierci kontynuuje swoją zbrodniczą działalność. Wszyscy troje bohaterów znajdzie się w śmiertelnym niebezpieczeństwie, gdy duch mordercy przybędzie do szkoły.

Po tym, jak tajemnicza dziewczyna okazuje się jedyną ocalałą z krwawego nalotu na placówkę badawczą stojącą za ściśle tajnym Programem Czarownic, zostaje uratowana przez parę, która nie rozumie poważnego niebezpieczeństwa w jakim się znaleźli. Jednak w miarę jak zabójcy, których zadaniem jest zlokalizowanie i uciszenie dziewczyny, zbliżają się coraz bardziej, życie całej trójki jest zagrożone.